L’episodio si apre da dove si era interrotto quello precedente: Locke, Kate e Sayid osservano Jack. Sayid crede che Jack potrebbe non voler essere più salvato, Locke propone di aspettare la notte e parlargli. Quando arriva la notte Kate va da Jack che le dice di andarsene perché è controllato ed infatti Kate viene subito catturata. Anche Sayid viene preso. Invece Locke è andato nell’abitazione di Ben, ma non gli interessa Jack, a lui interessa il sottomarino. Dopo qualche minuto arriva Tom con un altro uomo. Ben gli dice di portare l’uomo da Tallahassee. Ben capisce che a Locke non interessa il sottomarino per lasciare l’isola, ma vuole invece distruggerlo in modo che nessuno possa andarsene. Infatti Ben sa che Locke era paraplegico e sa anche cosa ha causato la sua paralisi. Intanto Jack dice a Kate che il giorno seguente lascerà l’isola ma tornerà per salvarla. Ben cerca di convincere Locke a rinunciare al suo piano distruttivo parlandogli di una scatola che può far apparire qualsiasi cosa una persona voglia. Questo non convince Locke che va al sottomarino e lo fa esplodere con l’esplosivo preso dalla stazione Fiamma. Locke viene catturato e Ben decide di mostrargli cosa è uscito dalla scatola. Locke guarda dentro una stanza e vede suo padre legato e imbavagliato.
I flashback ci mostrano Locke prima della paralisi. Un giorno un ragazzo gli chiede informazioni su suo padre. Infatti il padre sta cercando di truffare la madre del ragazzo. Locke va a parlare con suo padre di quello che gli ha detto il ragazzo. Il giorno dopo la polizia contatta Locke perché il ragazzo è morto. Quando Locke si presenta a casa del padre chiedendogli spiegazioni, Cooper nega di essere coinvolto nella morte del ragazzo e di aver annullato il matrimonio con la madre. Locke prende il telefono per accertarsi di quello che ha detto, ma non fa in tempo a chiamare perché suo padre lo scaraventa fuori dalla finestra. Locke si è rotto la schiena cadendo dall’ottavo piano. Vediamo anche la prima volta che Locke è stato messo sulla sedia a rotelle, piangendo.